在做PCR時,出現引物二聚體

2025-03-21 04:30:26 字數 3370 閱讀 6209

1樓:但山禹醉山

一。引物設計和樣品使用均是一樣的情況,就是反應條件的問題。

二。反應條件就看你的實驗操作和所使用的儀器,操作都一樣的話,儀器設定上出問題的可能性會大一些,其中退貨溫度是比較關鍵的。

三。人品問題也會導致這樣的情況。

四。一般減少引物二聚體。的方法:

從引物自身著手,重新賀廳舉設計引物,這是最根本解決這一問題的辦法;

可能模板有問題;

模板濃度過小,適當加大模板量;

taq酶,引物,mg2

濃度可能過高,可降低它們的濃度;

取你所要加的上下游引物混合後,在100攝氏度。

下的沸水中煮5分鐘,然後迅速拿出至於冰塊之上瞬時冷卻,這時再加入反應體系當中,引物二聚體就會消失的;

所配mix中加5%的甘油。

或者5%的dmso,可以增強特異性。

pcr反應體系的配製在冰上進行,最後加taq酶,pcr結束後,產物勿放置在室溫下過長時間,有人認為室溫下有些taq酶會將多餘的引物合成為二聚體;

增加迴圈數;

降低退火溫度。

後有條帶,則應逐漸提高溫度,若提高溫度的同時產物量減少,則考慮增加鎂離子濃度(根據擴增片斷長度而定,片段長則相應鎂離子濃度應該高一些);

若降低退火溫度,發現還是隻有引物二聚體,而且鎂離子的濃度在。

20-25mmol/l沒有區別,則考慮buffer等試劑沒有完全融解、混勻,導致吸取的試劑濃度不對;

以上次的pcr產物作模板二次pcr,可以伏昌提高引物與模板的特異性,減少引物二聚禪碧體,如果兩次時間間隔短的話,可以把原產物稀釋100-1000倍,如果間隔較長可以稀釋50-100倍。

2樓:僑枝糜寒梅

別的組的同學用的引物跟你的引物是一樣的嗎?如果一樣的話,那就要考慮您的模板質量碼拍的問題了。如果擴增不成功,電泳圖的底部都會有引物的遲脊羨條野旁帶。

3樓:網友

別的組的同學用的引物跟你的引物是一樣的嗎?如果一樣的話,那就要考慮您的模板質量的問題了。如果擴增不成功,電泳圖的底部都會有引物的條帶。

4樓:網友

那看你是做什麼實驗了,基本上出現引物二聚體沒什麼問題的,不影響實驗結果的。

普通pcr需要的引物對為()

5樓:閒風自適

a.一對引物肢旅。

b.半對引物。

c.兩對引物。

d.多對引飢飢衫物。

正確答案:a

引物是如何影響pcr反應的

6樓:逢奕琛醜倩

引物是pcr反應中非常重要的一環,我認為引物對pcr的影響主要體現在2方面:

1,影響pcr的特異性。

也就是說,所擴增的片段能否是你想要的特異性目的片段,而不是非特異性雜帶,一般來說,引物與模板序列匹配的越多,其特異性越好,察運但引物並不是越長越好,其原因就是下乙個方面;

2,影響pcr的效率,在退火環節中,引物越長,退火的反應就越慢,過長時就會阻礙pcr反應的順利進行,而引物短,則能更廳沒盯快的使引物與模板結合,但其特異性就下降,有可能會出現「亂搭」的情況;

除此之外,引物的gc含量扮和以及引物二聚體。

的存在,也會影響pcr反應,但我認為主要的還是上述2方面(因為如果不考慮酶切位點的情況,往往目的片段已定時,引物序列能調整的主要就是其長度),所以需要根據模板的情況和目的片段特點,選擇合適長度和起始的引物,對pcr的順利進行是很有幫助的。

如有疑問,歡迎繼續討論,純屬手打,歡迎,祝愉快!

為什麼體外pcr用dna做引物,而體內的用rna

7樓:庹望亭郭胭

因為pcr是人工合成的引物,rna在體外不穩定,而且容易被rna酶汙染,容易降解。所以用dna做pcr的引物。

而在體內的話,是因為dna聚合酶只能從一段核苷酸序列後的3`端上加上dntp,使dna鏈不斷延伸,而不能從頭開始合成dna鏈;而rna聚合酶則可以從頭開始合成rna鏈,所以就出現了在體內用rna做引物,來合成dna鏈的情況。

8樓:太史付友尚媚

dna複製起始階段dna聚合酶需要藉助rna引物後的3『-oh來將。

dntp連線到先導鏈上,然後啟用複製。而pcr只是一種單純的擴增技術,dna和rna均滿足條件。

pcr當中兩個引物分別是怎麼樣的?具體詳細的說一下。是怎麼設計的?兩個引物的關係以及在pcr中起的作用。

9樓:馬佳利葉武乙

引物是一小段核苷酸。pcr中,兩個引物分別與目地dna的2條子鏈的兩端互補,也就是如果從圖的平面來看:乙個引物與上一條鏈的左端互補,另乙個引物與下一條子鏈的右端互補。

所以兩個引物的序列是不相同的,這樣才不會亂。

引物的作用:有了引物分別與子鏈互補,那些單個的脫氧核苷酸才能夠開始連線上去。

10樓:万俟蘭歸鶯

pcr擴增的引物分上下游引物(或senseprimer,anti-sense

primer),pcr

所擴增的片段就是上下游引物在dna鏈上所擷取的片段。上游引物與模板5『端序列相同,下游引物與模板3』端序列反向互補。一般引物序列長度為18~25鹼基。primer5

來設計。兩引物共同確定pcr擴增的產物的大小及位置。

請教減少pcr產物中引物二聚體的方法

11樓:網友

博凌科為-為你解答:pcr反應過程中產生引物二聚體是做pcr的各位戰友經常遇到的問題,下面介紹一些減少引物二聚體的方法: 1.

從引物自身著手,重新設計引物,這是最根本解決這一問題的辦法;2. 可能模板有問題;3. 模板濃度過小,適當加大模板量;4.

taq酶,引物,mg2+濃度可能過高,可降低它們的濃度;5. 取你所要加的上下游引物混合後,在100攝氏度下的沸水中煮5分鐘,然後迅速拿出至於冰塊之上瞬時冷卻,這時再加入反應體系當中,引物二聚體就會消失的;6. 所配mix中加5%的甘油或者5%的dmso,可以增強特異性; 7.

pcr反應體系的配製在冰上進行,最後加taq酶,pcr結束後,產物勿放置在室溫下過長時間,有人認為室溫下有些taq酶會將多餘的引物合成為二聚體; 8. 增加迴圈數;9. 降低退火溫度後有條帶,則應逐漸提高溫度,若提高溫度的同時產物量減少,則考慮增加鎂離子濃度(根據擴增片斷長度而定,片段長則相應鎂離子濃度應該高一 些);10.

若降低退火溫度,發現還是隻有引物二聚體,而且鎂離子的濃度在 20-25mmol/l沒有區別,則考慮buffer等試劑沒有完全融解、混勻,導致吸取的試劑濃度不對;11. 以上次的pcr產物作模板二次pcr,可以提高引物與模板的特異性,減少引物二聚體,如果兩次時間間隔短的話,可以把原產物稀釋100-1000倍,如果 間隔較長可以稀釋50-100倍。

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