農業景觀在設計中應遵循哪些原則,PCR引物設計應遵循哪些原則

2021-05-28 20:15:54 字數 5374 閱讀 2123

1樓:植物網

(一)生態的原則

(二)高效益原則

(三)參與性原則

(四)突出特色的原則

(五)文化渲染的原則

pcr引物設計應遵循哪些原則

2樓:北京索萊寶科技****

pcr引物設計的11條**法則

1.引物最好在模板cdna的保守區內設計。 dna序列的保守區是通過物種間相似序列的比較確定的。

在ncbi上搜尋不同物種的同一基因,通過序列分析軟體(比如dnaman)比對(alignment),各基因相同的序列就是該基因的保守區。

2.引物長度一般在15~30鹼基之間。 引物長度(primerlength)常用的是18-27bp,但不應大於38,因為過長會導致其延伸溫度大於74℃,不適於taqdna聚合酶進行反應。

3.引物gc含量在40%~60%之間,tm值最好接近72℃。 gc含量(***position)過高或過低都不利於引發反應。

上下游引物的gc含量不能相差太大。另外,上下游引物的tm值(meltingtemperature)是寡核苷酸的解鏈溫度,即在一定鹽濃度條件下,50%寡核苷酸雙鏈解鏈的溫度。有效啟動溫度,一般高於tm值5~10℃。

若按公式tm=4(g+c)+2(a+t)估計引物的tm值,則有效引物的tm為55~80℃,其tm值最好接近72℃以使復性條件最佳。

4.引物3′端要避開密碼子的第3位。 如擴增編碼區域,引物3′端不要終止於密碼子的第3位,因密碼子的第3位易發生簡併,會影響擴增的特異性與效率。

5.引物3′端不能選擇a,最好選擇t。 引物3′端錯配時,不同鹼基引發效率存在著很大的差異,當末位的鹼基為a時,即使在錯配的情況下,也能有引發鏈的合成,而當末位鏈為t時,錯配的引發效率大大降低,g、c錯配的引發效率介於a、t之間,所以3′端最好選擇t。

6.鹼基要隨機分佈。引物序列在模板內應當沒有相似性較高,尤其是3』端相似性較高的列,否則容易導致錯誤引發(falsepriming)。

降低引物與模板相似性的一種方法是,引物中四種鹼基的分佈最好是隨機的,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。尤其3′端不應超過3個連續的g或c,因這樣會使引物在gc富集序列區錯誤引發。

7.引物自身及引物之間不應存在互補序列。引物自身不應存在互補序列,否則引物自身會摺疊成髮夾結構(hairpin)使引物本身復性。

這種二級結構會因空間位阻而影響引物與模板的復性結合。引物自身不能有連續4個鹼基的互補。兩引物之間也不應具有互補性,尤其應避免3′端的互補重疊以防止引物二聚體(dimer與crossdimer)的形成。

引物之間不能有連續4個鹼基的互補。引物二聚體及髮夾結構如果不可避免的話,應儘量使其△g值不要過高(應小於4.5kcal/mol)。

否則易導致產生引物二聚體帶,並且降低引物有效濃度而使pcr反應不能正常進行。

8.引物5′端和中間△g值應該相對較高,而3′端△g值較低。 △g值是指dna雙鏈形成所需的自由能,它反映了雙鏈結構內部鹼基對的相對穩定性,△g值越大,則雙鏈越穩定。

應當選用5′端和中間△g值相對較高,而3′端△g值較低(絕對值不超過9)的引物。引物3′端的△g值過高,容易在錯配位點形成雙鏈結構並引發dna聚合反應。(不同位置的△g值可以用oligo6軟體進行分析)

9.引物的5′端可以修飾,而3′端不可修飾。 引物的5′端決定著pcr產物的長度,它對擴增特異性影響不大。

因此,可以被修飾而不影響擴增的特異性。引物5′端修飾包括:加酶切位點;標記生物素、熒光、地高辛、eu3+等;引入蛋白質結合dna序列;引入點突變、插入突變、缺失突變序列;引入啟動子序列等。

引物的延伸是從3′端開始的,不能進行任何修飾。3′端也不能有形成任何二級結構可能。

10.擴增產物的單鏈不能形成二級結構。某些引物無效的主要原因是擴增產物單鏈二級結構的影響,選擇擴增片段時最好避開二級結構區域。

用有關軟體(比如rnastructure)可以**估計mrna的穩定二級結構,有助於選擇模板。實驗表明,待擴區域自由能(△g°)小於58.6lkj/mol時,擴增往往不能成功。

若不能避開這一區域時,用7-deaza-2′-脫氧gtp取代dgtp對擴增的成功是有幫助的。

11.引物應具有特異性。 引物設計完成以後,應對其進行blast檢測。如果與其它基因不具有互補性,就可以進行下一步的實驗了。

3樓:匿名使用者

長度18-25bp,沒有錯配,3』端不是a,gc含量在40到60%

4樓:匿名使用者

1、引物長度一般為15-30bp,常用的為18-27bp,但不能大於38bp;

2、引物gc含量一般為40%-60%,以45-55%為宜,上下游引物gc含量和tm值要保持接近;

3、引物所對應的模板序列的tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之間,tm值曲線以選取72度附近為佳,5'到 3』的下降形狀也有利於引物與模板的結合;

4、δg值(自由能)反應了引物與模板結合的強弱程度,3'端的δg值相對要低,且絕對值不要超過9,否則不利於正確引發反應,3'末端雙鏈的δg值在0--2kcal/mol時,pcr產量幾乎達到百分之百,但在-6時只達到40%,-8時少於20%,-10時接近於0;

5、錯配率一般不要超過100,否則會出現非目的條帶。但對於某些特定的模板序列,還應結合比較其在正確位點的引發效率。如果兩者相差很大,比如在正確位點的引發效率為340以上,而在錯誤位點的引發效率為110,並且不好找到其他更合適的引物,那麼這對引物是可以接受的;

6、frq曲線為oligo6軟體新引進的一個指標,解釋了序列片段存在的重複機率大小,選取引物時,應該用frq值相對較低的片段;

7、引物二聚體及髮卡結構的能量的絕對值一般不要超過4.5,否則容易產生引物二聚體而且會降低引物濃度從而導致pcr不能正常發生;

8、3'端最好不要是連續鹼基,ggg或ccc會導致錯誤的引發,同時3'端最後一個鹼基最好不要是a或t,若是,會導致錯配;

9、以公式tm=4*(g+c)+2*(a+t)-5計算tm值,也就是退火溫度。選擇較低tm值的引物的退火溫度為反應的退火溫度,最好保證每個引物的tm值相匹配,且在70-75℃範圍內;

10、模板與穩定性較小的引物之間的tm的差異越小,pcr的效率越高。因為解鏈溫度也取決於它的長度,如果期待的產物長度等於或小於500bp,選用端的引物(16-18bp),如果產物長5kb,則用24bp的引物;

11、在dna測序和pcr中最好用5'末端穩定(gc含量多),而3'端不穩定(at含量多)的引物,這種引物的結構可以有效地消除假引發反應;

12、引物和產物之間的tm值相差別太大,20攝氏度範圍內最好。

13、對引物的修飾一般在5'端進行,例如加酶切位點,加酶切位點的同時要根據需要新增保護鹼基。

園林景觀的設計需要遵循哪些原則

5樓:alone_樹

一、園林景觀設計的基本原則:

(1)構園有法,法無定式;

(2)功能明確,組景有方;

(3)因地制宜,景以境出(①頤和園主景突出式②圓明園集景式③避暑山莊風景式);

(4)掇山理水,理及精微(山有三遠,深遠、平遠、幽遠。水之三遠,曠遠、幽遠、迷遠);(

(5)建築經營,時景為精;

(6)道路系統,順勢通暢;

(7)植物造景,四時爛漫。

二、設計要點

1、園林景觀設計要的是什麼效果?

實用、經濟、美觀。

三、八項要求

園林點景中有八項注意,或叫八項要求:

一、襯托、烘托要相稱。如(紅樓夢)中「大觀園稻香村」一景,除有杏花村詩意的主景,菜畦、油菜花、土井、轆轤等配景外,賈珍又提出「只養些鴨、鵝、 雞之類才相稱」。這「相稱」二字便是點景妙諦。

二、是平衡畫面要相宜。即點景要使原景在色調風格上、主賓關係上、景觀質量上更顯輕重得宜,濃淡有致。

三、是對比照應要有目的。有時發覺主賓、濃淡、輕重等關係不夠明顯時,可通過對比照應的手法,在原景物的旁邊再增加一組在比例上、體量上和色度上有較大反差變化的景物,達到以此顯彼的目的。

四、是聯絡要有節奏變化,若斷若續。園林景區景點之間或景觀景物之間距離過大,有分散感時,可於其間點綴一些景物作「過渡」,達到聯絡有致。

五、是鎮定畫面要有力 園林景觀設計遵循原則園林設計。有的景境里布置的景物比較繁雜,顯得熱鬧躁動時,應使用另一種比較有分量的景物點景,達到統攝鎮定的目的

六、是強調加深要適度。如發現原有景觀的色彩、態勢、質惑等的分量氣氛不夠時,可應用加重、加密、加深、加高、加長等點景手法予以強調。

七、是逗引引導要藏露結合。當景點被山林遮蔽時,可點以高塔、危亭等露於林梢,或在景境外點以路亭、牌坊等,藉以引導遊人尋幽訪勝。

八、是暗示隱喻要高雅。若景觀意境過於含蓄,景意用典形式來點景,達到為遊人解惑的目的。

園林景觀設計中景觀燈應遵循哪些設計原則

6樓:實戰建築培訓

園林景觀設計中的景觀燈設計要遵循如下原則:

1、滿足夜間照明的需要,照度要經過照明設計。

2、要滿足美觀設計要求,由於園林景觀屬於公共環境,能夠賞心悅目,要給人以美感。

3、燈具要滿足節能要求,儘量採用節能燈或太陽能燈。

豬舍設計應遵循哪些原則?

7樓:中國農業出版社

豬舍是豬生活的地方,如豬舍環境不良,豬的生長髮育就要受到影響。因此,在修建豬舍時,首先應考慮不同豬群生長髮育的要求,同時也應力求做到先進、合理、經濟、實用,易就地取材。豬舍設計必須遵循以下基本原則:

(1)符合豬的生物學特性要求

豬舍設計應利於保持溫度和溼度,保證舍內空氣清新,光照充足。尤其是種公豬更需要充足的陽光,以激發其旺盛的繁殖機能。

(2)適應當地的氣候及地理條件

各地的自然氣候及地理條件不同,對豬舍的建築要求也各有差異。長江以南地區,氣溫較高,應將防暑降溫作為設計的重點。長江以北地區,高燥寒冷,應將防寒保暖和通風換氣作為設計的重點。

(3)便於實行科學的飼養管理

在設計豬舍時應充分考慮到符合養豬生產工藝流程,符合各類專業豬舍的特定要求,操作方便,利於日常操作和實現機械化,便於實施科學的飼養管理。

(4)安全、衛生、舒適

豬舍設計要考慮結構牢固、安全、衛生、適用,冬暖夏涼、透光通風,乾燥,便於清掃,突出環保意識,注重生物安全,保證良好的生態環境。

(5)經濟適用

①綜合考慮當地的土地、人力、水電、飼料、建築、汙物治理等關係長遠的成本因素以及自身的經濟實力,確定最適宜的生產工藝和飼養模式,在此基礎上,確定豬舍的最佳設計方案,建築的造價要在能夠承受的範圍之內。

②要與現代化的規模豬場所採用的新材料、新技術、新工藝、新裝置相配套,運轉成本要低。

(6)便於採用封閉式飼養

規模豬場機械化程度較高,裝置較先進,很多豬場都配有自動飼餵料系統、溼簾通風降溫系統、自動保溫系統、機械化清糞系統等,而敞開式或半敞開式的建築難以適應上述系統配置的需要;同時,採用封閉式飼養模式還有利於防疫,有利於實現雨汙分離。因此在豬舍設計上必須考慮封閉式建築、封閉式飼養模式。

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不知道你的壓板用在 的,要看使用環境 一般用途的壓板採用45 淬火回火hrc40 45 設計焊接工裝夾具時應遵循哪些基本原則 一 工裝夾具設計的基本原則 1.滿足使用過程中工件定位的穩定性和可靠性 2.有足夠的承載或夾持力度以保證工件在工裝夾具上進行的施工過程 3.滿足裝夾過程中的簡單與快速操作 4...

上述提問體現了課堂問題設計應遵循哪些原則

1 整體性原則 來整體性是指教學 自過程中所表 bai現出來的教學du人物與教學目標 教學內容與教zhi學組織 課程實dao施與課程開發 教學方式與學習方式等方面和諧完整的形態 2 主體性原則 主體性是人的本質特性,主體性在構成上有三個層次,即自主性 主動性 創造性。3 發展性原則 新課程改革的根本...

提出假設要遵循哪些原則?科學假說應遵循哪些原則

為什麼做假設?首先談談為什麼要做假設,這是很多人首先感到困惑的地方。其實假設在實際生活中無處不在,只是人們沒有意識到這些是假設問題。一般當你要對一件事物做出判斷的時候,其中就隱含著假設。你在小區裡看到一個人形跡可疑,會懷疑這個人是不是小偷,這裡面就隱含著兩個對立的假設 是或不是 少男少女們陷入情網時...