1樓：濮陽惜珍
都有啊。你想做蛋白質氨基酸序列的同源分析當然就用氨基酸序列了，做某段非蛋白編碼序列的分析那肯定是用核苷酸序列啊。進化樹我沒正式地做過，這裡就不多說了，我以前玩票的時候用的是aa序列。
我呆的組做同源性分析（印象裡都御晌凳是針對編碼蛋白質的基因）有時是cdna序列，有時是aa序列，貌似用aa序列為多。做rnai時測序的轉殖比對時一般就直接用測序的核苷酸序列（我們rnai的轉殖一般是針對外顯子設計的片段，sourcebioscience的線蟲genomic library）。
一般來說，比較同源蛋白，用cdna和蛋白序列都可以。只不過蛋白更能看出保守區域，核酸的話，可能突變比較多沒有，而且只有四種，沒有二十種的氨基酸靠譜。如果，做小的基因組的比較，比如病毒序列，一般用全基因組，即核酸進行進化分析。
其實最重要的是你的物種直接的親緣關係遠近及對模型的了鎮旅解，選擇合適的方法。具體看楊子恆和其他大牛的書。樹好畫，理論解釋比較難。
距離較遠的序列比較用氨基酸序列更合適，進化距離很近的序列之間比較用核酸更合適。 親緣關係較近的序列比較，如果用aa序列，很多同義突變的資訊都會漏掉；而親緣較遠的序列之間做align，重要的是功能謹譽保守的domain要對齊，這個時候用aa序列就比dna序列方便一點。 我個人來說，如果可以用dna align好就儘量用dna，這個時候要再translate到aa也方便。
有的序列可能用dna 不好align我才會用aa序列align。有了alignment再做樹就簡單了。就我個人經驗，相同的序列dna樹要可靠一點，因為aa樹受自然選擇影響更大（也可能是和我研究的序列相似性較高有關）。
2樓：彤蛋卉
所謂微生物同源分析，就是在一定的條件下，微生物菌株的進化關係的遠近，隨著技術的發展，人類的對於研究進化關係的遠近的技術也發生著變化，形態學、生化方法、血隱改慶清學分析、條帶分型、單基因分灶握型、多基因分型、基因組分型等等，技術本身的解像度也有高低之分。 pfge是一種條帶分型方法，相比生化、形態學解像度比較高，與血清學或者多基因分型相比，解像度相當（有時前者高，有時後者高），基因組分型的解像度最高。 mrsa常用的分型包括spa分型、pfge分型、mlst分型以及全基因組分型，根據實驗目的和預算來選擇，spa和mlst可以用pcr的方法，最多送一代測序，pfge和全基因殲枯組都需要特定的裝置儀器，一般外包做，如果預算還可以的話建議全基因組分型解決問題。
3樓：輕盈且溫順的小愛侶
直向同源基因(orthologous gene)又譯為「垂直同源基因」、「正同源基因」 或「定向進化同源基因」、「直系同源基因」，是指從同一祖先垂直進化而來的基因。或返衡漏者說，乙個祖先攔明物種分化產生兩種新物種，那麼這兩種新物種共同具有的由這個祖先物種繼承下來的基因就稱為直向同源基因。直向同源基因通常是編碼生命必需的酶、輔酶或關鍵性的調控蛋白的基因，具有功能保守，進化緩慢，變化速度可覆蓋整個進化歷史，且序列變化速度與進化距離相當等特徵。
大多數直向同源基因功能相同或相近，調控途徑也相似， 因此在基因組序列的註釋漏爛中，是最可靠的選擇，例如人α一珠蛋白基因與小鼠α一珠蛋白基因。<>
基於核酸序列和氨基酸序列的進化分析有何差異
4樓：匿名使用者
相似性和同源性：相似性（similarity）和同源性( homology)是兩個完全不同的概念。同源序列是指從某一共同祖先經過趨異進化而形成的不同序列。
相似性是指序列比對過程中檢測序列和目標序列之間相同鹼基或氨基酸殘基序列所佔比例的大小。當兩條序列同源時，它們的氨基酸或核苷酸序列通常有顯著的一致性（identity）.如果兩條序列有乙個共同的進化祖先，那麼它們是同源的。
這裡不存在同源性（homology）的程度問題，兩條序列要麼是同源的要麼是不同源的。
氨基酸的序列多樣性
5樓：單獻裴秀妮
考點： 蛋白質分子結構多樣性的原因 專題： 分析：
蛋白質多樣性的直接原因是組成蛋白質的氨基酸的種類、數目、排列順序和空間結構不同． a、構成蛋白質分子的氨基酸種類不同是蛋白質多樣性的原因之一，a錯誤；b、構成蛋白質分子的氨基酸的排列順序不同是蛋白質多樣性的原因之一，b錯誤；c、蛋白質分子的空間結構同是蛋白質多樣性的原因之一，c錯誤；d、連線氨基酸之間悔頃的碧虛陸化學鍵相同，都是譽大肽鍵，d正確．故選：d． 點評： 對於蛋白質多樣性的原因的理解、識記是本題考查的重點．
已知氨基酸序列如何確定mrna鹼基序列
6樓：
答案a乙個氨基酸可以對應乙個或多個密碼子，而密碼子是mrna上特定的鹼基序列，按照氨基酸的順序可以確定mrna鹼基序列。
同源蛋白質氨基酸序列的這種相似性稱為
7樓：奈子
同源蛋白質的氨基酸。
序列具有明顯的相似性，這種相似性稱為序列同源性。具有序列同源性的蛋白質稱為同遲芹源蛋白質，同源畝純蛋白共有的相似序列稱為共義序列。
一）同源蛋白質的物種差異與生物進化。
同源蛋白質、細胞色迅旦咐素c、系統樹。
二）同源蛋白質具有共同的進化起源。
氧合血紅素蛋白質、絲氨酸蛋白酶類。
基因是核苷酸數列還是性狀
8樓：網友
基因是遺傳的物質基礎，是dna或rna分子上具有遺傳資訊的特定核苷酸序列。
因此，基因不是指某乙個鹼基對，或者某乙個鹼基，而是指在dna上一段具有遺傳資訊的核苷酸序列。特意強調的是具有遺傳資訊者幾個字，因為一條dna上不是所有的基因都具有遺傳資訊，一條dna上可能只有若干的基因會具有遺傳資訊。
答：因為dna上含有若干個基因，而每乙個基因通過翻譯為rna，在通過rna的轉錄，形成具有與該基因決定具備相關功能的蛋白質。因此，只能說是基因來指導蛋白質合成，而不能說成是dna。
最後，aa aa aa是神馬，他們難道也是鹼基對？
答，這是等位基因，不是鹼基對。即可以說a或者a這兩個等位基因，每乙個是由若干的鹼基對構成的。
不知道我表述清楚沒有，如果您還有需要解釋的請追問。
基因文庫核苷酸序列
9樓：學碧呂語風
a、基因的核苷酸序列可作為從基因文庫中獲取目的基因的根鬧判蔽據；
b、基因的功能可作為從基因文庫中獲取目的基因的根據；
c、基因的轉錄產物mrna可作為從基因文庫中獲取目的基因的根據；
d、a、b和c選項均可作液州為從基因文衝李庫中獲取目的基因的根據．故選：d．
氨基酸酸序列對比結果可用來研究什麼？核苷酸序列對比結果又可用來研究什麼？求大神解惑！
10樓：網友
由於密碼子的簡併性，核苷酸的變異不一定導致氨基酸的變異，所以氨基酸酸序列對比是相對於蛋白水平的，氨基酸的變異有可能導致蛋白質三維機構摺疊的不同，最終影響其功能。
核苷酸的變異現在一般用來做標記，或者是是作為某上游關鍵結合因子變異導致其結合蛋白無法結合上去。
說白了乙個是蛋白水平，乙個是基因水平。
什麼叫核苷酸序列
11樓：0o壹次心
核苷酸序列就是指dna或rna中鹼基的排列順序。
這意味著dna中a,t,g,c的排列循序，或者mrna中a,u,g,c的排列循序，也包括rrna,trna中鹼基的排列順序。
環核苷酸不存在核苷酸序列。
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