1樓：匿名使用者
測序深度是測序量除以基因組長度，例如測序深度10*就相當於測了10次的全基因組
深度測序和普通的二代測序有什麼區別？有什麼應用
2樓：淵源
有兩種體細胞突變容易被忽視，一種是侷限在特定組織的突變。舉例來說，如果突變只存在於大腦，而我們檢測的是血液，那就找不到這些致病突變。另一種致病性體細胞突變雖然發生在所有組織中，但是隻影響一部分細胞，因此不容易被檢測到。
普通的二代測序，全基因組或外顯子組測序是將dna分成小片段，然後對各個片段多次讀取（一般是三十次）。然而，如果突變只發生在15-20%的細胞中，三十次讀取還不足以可靠地捕捉到它們，尤其是當突變隻影響一個基因拷貝時。
walsh和博士後saumya jamuar通過「定向高覆蓋度測序」技術，為158名腦部疾病的患者鑑定致病突變，這些患者的症狀包括癲癇、智力障礙、語言障礙等。
研究人員並沒有分析整個基因組或外顯子組（所有蛋白編碼基因），而是把注意力放在一系列已知或有嫌疑的基因上，並且大大提高了測序的深度。
在一些疾病如唐氏綜合徵中，嵌合突變相較於影響全身細胞的突變，產生的症狀要輕一些。但是很少量的變異細胞就足以引發損害人身心健康的症狀，在以往的研究中，為了從普通基因組中檢測到這些突變，研究人員就不得不增加測定的序列數量。而對少數候選基因區域進行的平均300次深度測序，就可以有效辨別被誤認為測序錯誤的突變。
為什麼二代測序又叫深度測序
3樓：士誠小人也
在二代測序中，為了有效覆蓋全基因組，獲得的資料量一般是被測基因組的幾十倍，然後再拼接。
也就是說，理論上，每個位點都要被覆蓋幾十次甚至上百次，這個次數就叫測序深度
所以，二代測序也成為深度測序
測序深度 5
4樓：美吉生物
測序得到的鹼基總數就是原始的測序資料，其中會包括一些低質量的鹼基，通過去除低質量的鹼基，再去除片段過短的序列，得到高質量的序列用於後續分析。一般評價測序深度都是用過濾之後高質量的序列來進行評估的，這些序列也將參與後續的分析。
高通量基因組測序中，什麼是測序深度和覆蓋
5樓：匿名使用者
簡潔版：
深度即：測序得到的總鹼基數/基因組鹼基數 。也可以理解為將基因組測了幾遍。
測序深度能減少假陽性和測序錯誤率。 覆蓋度原來是指基因/轉錄組上測序測到的部分佔整個組的比例，但是現在很多人把coverage也直接當depth用了。
詳細版： depth嘛，就是被測基因組上單個鹼基被測序的平均次數，比如某樣本的測序深度為30x，那麼就是說該樣本的基因組上每一個單鹼基平均被測序（或者說讀取）了30次，注意，是平均。當然了，depth也有最大和最小值，這個都可以由資訊分析得到。
coverage就好理解了，由於大片段拼接的gap、測序讀長有限、重複序列等問題的存在，測序分析後組裝得到的基因組序列通常無法完全覆蓋所有區域，覆蓋度就是最終得到的結果佔整個基因組的比例。例如一個人的基因組測序，覆蓋度為98.5%，那麼說明該基因組還有1.
5%的區域通過我們的組裝和分析無法得到。
至於什麼演算法之類的，太深了，應該不用瞭解吧~~偶也寫不出來。。。:p
當然，轉錄組也同上，
6樓：豆穎環力學
可以簡單理解為深度是一條鏈上一個鹼基檢測到的次數,
覆蓋度是你檢測到的這個樣本的總鹼基數的百分比
基因組測序中，什麼是測序深度和覆蓋度
7樓：小小大大
測序深度是指bai測序資料對基因組du覆蓋深zhi度，如人類基因組有dao3g，我們測了過濾回得到clean data 90g資料量，那麼答測序深度是90/3=30x，覆蓋度是，90g資料比對到人類參考基因組上，可以覆蓋基因組的比例，如覆蓋度80%
基因組測序的測序深度一般是多少
8樓：道峰山營
基因組測序的測序深度一般是10x。
測序深度是指測序得到的總鹼基數與待測基因組大小的比值。假設一個基因大小為2m，測序深度為10x，那麼獲得的總資料量為20m。
基因測序是一種新型基因檢測技術，能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列，**罹患多種疾病的可能性，個體的行為特徵及行為合理，如癌症或白血病，運動天賦，酒量等。
illumina二代測序的比較完整的介紹，比如什麼是文庫，什麼是測序深度
9樓：林少鳳
不同的測序型別這個對於濃度 純度 總量完整度都有不同的要求 主要是你用來那資料是做什麼，如常見基因組樣品，總量要在1微克以上，且條帶明顯。
深度測序和普通的二代測序有什麼區別？有什麼應用
有兩種體細胞突變容易被忽視，一種是侷限在特定組織的突變。舉例來說，如果突變只存在於大腦，而我們檢測的是血液，那就找不到這些致病突變。另一種致病性體細胞突變雖然發生在所有組織中，但是隻影響一部分細胞，因此不容易被檢測到。普通的二代測序，全基因組或外顯子組測序是將dna分成小片段，然後對各個片段多次讀取...
什麼是主副歌，什麼叫主歌和副歌
主歌是主題曲和片尾曲 副歌是插曲 副歌和主歌有什麼區別？一首歌的副歌和主歌是什麼,是哪部分?歌曲中的副歌是什麼意思 副歌就是指那內容區別於主歌，發展與概括性比較強的且在節奏情感曲調上與主歌形成對比的那一段。通常一首歌的構造就是由前奏，兩段主歌，一段副歌，過門 再來一次的副歌和主歌，以及結尾 順序地連...
轉其因是什麼意思，什麼叫非轉其因食品
轉基因 指的是將某些物種的編碼某些優秀性狀的基因轉入對人類有生存意義的動物或植物或者微生物的基因組裡面去。以使得這些物種表達出其自身缺乏的優秀性狀。比如 小麥的抗倒伏性狀，可能沒有，這個性狀可能在野草裡面有，最終是通過基因組中的一個或者多個基因所調控和表達的蛋白的作用來實現的，那麼將這個基因或者這些...