新一代測序中,基因從頭測序和重測序有什麼區別?我要做乙肝病毒

2021-05-18 19:11:09 字數 5356 閱讀 1521

1樓:那年丶人已散盡

1、條件不同

從頭測序的條件是不依賴於任何物種基因組;重測序的條件是在已知物種基因組的情況下進行的。

2、病毒變異率不同

從頭測序是通過拼接和組裝的方式獲得基因組序列圖譜,病毒變異率很低;重測序可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點,插入缺失位點,結構變異位點,拷貝數變異等變異資訊,從而獲得生物群體的遺傳特徵。病毒變異率很高。

乙肝病毒在醫學上已經測過,只需要做重測序就可以。

2樓:匿名使用者

從頭測序是目前為止還沒有人測過那個物種的全基因組,沒有參考序列進行比對,需要自己組裝拼接後才能知道序列;而重測序是已經有人測過了,只需要重新測序,有參考序列了,只需要與參考序列比對。

乙肝病毒好像是已經測過的,只需要做重測序就可以!

3樓:美吉生物

基因從頭測序也叫做基因de novo測序,是指不依賴於任何已知基因組序列資訊對某個物種的基因組進行測序,然後應用生物資訊學手段對測序序列進行拼接和組裝,最終獲得該物種基因組序列圖譜。

重測序是指在已知物種基因組的情況下,對物種內的不同個體或某個個體的不同組織進行基因組重測序,可以在全基因組水平上發現不同個體或組織細胞之間的差異。通過這種方法,可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點(snp),插入缺失位點(indel,insertion deletion),結構變異位點(sv,structure variation),拷貝數變異(copy number variation,**v)等變異資訊,從而獲得生物群體的遺傳特徵。

病毒變異率很高,一般不用重測序,可以用de novo從頭測序。

4樓:匿名使用者

專業性東西,自己看看這個

資料

全基因組重測序和基因組測序有什麼區別

5樓:匿名使用者

沒什麼區別吧。習慣說法的關係。是全基因組測序和重測序有點不同。

dna 的 1代測序,2代測序,3代測序的區別是什麼啊?

6樓:垠元

第一代測序:指雙脫氧末端終止法,擴增後通過毛細管電泳讀取序列,每次獲取資料量少。

第二代測序:為高通量測序,採用微珠或高密度晶片邊合成邊測序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次獲得數g資料,相對與第三代,都仍然需要擴增的方法放大訊號,擴增後再檢測。

第三代測序:特點是單分子測序,多基於奈米科技,無需擴增,對單分鏈dna/rna直接用合成、降解、通過奈米孔等方式直接測序,核心特點是無需擴增所以成本更低。

7樓:匿名使用者

你說的1代2代指的是子代1代,2代嗎?原本的雙鏈dna就是親代,以親本為模板複製產生的子代dna就是子1代,子2代.....

什麼是普通的基因測序,它和高通量測序有什麼區別嗎

8樓:邂逅

「普通的基因測序」應該

是指「常規dna測序」吧,是用sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。

高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2023年的時候,3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。

不過到2023年以後,高通量測序就改指第二代測序(next generation sequencing),454、solexa(後改為illumina)和solid等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。

ngs的特點主要有:

1、通量高。一個run能產生500mb-600gb的資料量。

2、讀長相對較短。454(約400-500bp),llumina(100-250bp),solid(75-100)。

3、單位資料的成本非常低。現在很多專案測序的費用。已經非常低。生物資訊分析成本變得更為重要了。

簡化基因組測序和基因組測序的區別

9樓:匿名使用者

一、16s測序原理16srdna基因存在於所有細菌的基因組中,具有高度保守性。然而該基因序列還包括9個高變區(v1-v9),通過特異性引物對某一段高變區(如v3區)或某幾段高變區(如v3-v4區)進行擴增測序,然後與資料庫比對,可特異性識別細菌種類。

二、巨集基因組測序原理將基因組dna隨機打斷成若干條500bp的小片段(類似於拼圖中的單個形狀不一的模組),然後連線接頭(雙端120bp),在片段兩端加通用引物進行pcr擴增測序。將reads進行組裝拼接(類似於將眾多模組拼成一副完整**),得到基因序列,眾多基因構成完整的基因集。同時將獲得的reads片段或組裝好的基因序列與ncbi資料庫進行比對,得到物種註釋結果。

對於16s測序而言,任何一個高變區或幾個高變區,儘管變異性再高,對於某些物種來說,這些高變區也可能十分相近,而能夠區分它們的特異性序列片段有可能不在我們的擴增區域內。換言之,非全長的可變區序列覆蓋範圍不夠導致無法鑑定到種。巨集基因組在建庫之前會先將基因組dna隨機打斷成若干小片段,而這些小片段中總有一些能夠包含區分2個物種的基因差異序列。

由於測序深度足夠深,相當於覆蓋了整個基因組的資訊,因此在與ncbi資料庫比對時,就能夠註釋到相應的種水平的物種。

什麼是普通的基因測序,它和高通量測序有什麼區別嗎?

10樓:匿名使用者

「普通的基因測序」應該是指「常規dna測序」吧,是用sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。

高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2023年的時候,3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。

不過到2023年以後,高通量測序就改指第二代測序(next generation sequencing),454、solexa(後改為illumina)和solid等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。

ngs的特點主要有:

1、通量高,一個run能產生500mb-600gb的資料量

2、讀長相對較短,454(約400-500bp), illumina(100-250bp),solid(75-100)

3、單位資料的成本非常低,現在很多專案測序的費用,已經非常低,生物資訊分析成本變得更為重要了。

11樓:美吉生物

普通的基因測序即常規測序,高通量測序技術(

high-throughput sequencing)又稱「下一代」測序技術("next-generation" sequencing technology),以能一次並行對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定和一般讀長較短等為標誌。

高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。

全基因測序和一般基因檢測的區別

12樓:北京索萊寶科技****

基因測序是測出dna上的鹼基是a,c,g,t中的哪一個;

而基因檢測是通過雜交或測序等方法來確定dna序列中是否含有特定的一段序列,來明確相關的基因某些功能。比如耳聾基因檢測就是用晶片來檢測一個正常人是否攜帶隱性先天性耳聾基因或者藥敏性耳聾基因。

測序只是得到dna的序列,而檢測是最終要跟功能建立聯絡。

13樓:金英傑教育

基因檢測的作用就在於此:它可以先判定某人的cyp2c9是否發生了突變,並判定他屬於哪種代謝型別,然後再根據代謝型別決定藥物劑量。

如果是強代謝型,那就適當提高劑量;如果是弱代謝型,那就降低劑量並注意藥物在血液中的含量。這樣就既保證了藥物達到**效果,也不會出現adr。

一般基因檢測只是對某一個或幾個基因或者某一個基因上特定片段或者特定位點的鹼基對測序。

全基因測序是指一個生物體攜帶的所有基因資訊測序,包括所有染色體上所有基因和非基因的鹼基對測序,線粒體核糖體上的鹼基對測序。

基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術 。

基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,**罹患多種疾病的可能性,個體的行為特徵及行為合理,如癌症或白血病,運動天賦,酒量等  。

14樓:徵求幫助

全基因測序是指一個生物體攜帶的所有基因資訊測序,包括所有染色體上所有基因和非基因的鹼基對測序,線粒體核糖體上的鹼基對測序。

一般基因檢測只是對某一個或幾個基因或者某一個基因上特定片段或者特定位點的鹼基對測序

15樓:衛豐心理說客

全基因測序:

無重點的 對人體30億個鹼基進行全部測序。檢測內容多,這樣勢必單價高,價效比低。錢多任性的選擇。

一般基因檢測:

有重點、有選擇的進行檢測基因鹼基順序,根據個人明確的目的和需求,比如腫瘤易感性,心腦血管易感性、靶向用藥前檢測等等。針對性強,檢測的內容相對明確且偏少。這樣可以增加檢測的價效比,較為實用。

基譜生物為您解答。

rna測序與整個基因組測序相比有什麼優勢

16樓:加菲熊貓

朋友你好!

雖然rna種類多樣,但我們拿來測序的一般是信使rna即mrna。眾所周知mrna是核內基因表達時通過轉錄修飾後的產物,其直接通過招募核糖體結合trna進行翻譯表達。因此相比於dna,mrna上既沒有複雜龐大的非表達dna部分(這類dna元件不會轉錄出mrna),也不含內含子等表達基因的冗餘部分,可以說mrna是最接近所表達的蛋白產物的模板了。

因此rna測序直觀,簡潔,高效的反映了某一時刻生物體蛋白質的表達水平,具有簡潔性和時效性。

希望幫到你,歡迎追問~

17樓:手機使用者

網頁連結

rna-seq助力遺傳疾病診斷

18樓:菅勃紀曼安

rna測序也就是所謂的rna-seq,通常指的是轉錄組測序,只測細胞中的轉錄本。只有基因組中被轉錄出來的那部分能測到。通常用於尋找差異表達基因以及發現新基因。

而基因組測序是整個基因組都測,不管轉錄不轉錄,通常用於基因組組裝,重測序進行基因分型等。

這是根本不同的兩個東西,一個是測轉錄組,一個是測基因組,它們的不同就是轉錄組和基因組的不同。至於優勢,根據自己的目的來判斷吧。

歡迎追問。

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