1樓：莫奇怪最帥
read是讀長,就是一個反應能測出的鹼基數 congtig是將很多read根據序列拼接在一起拼出的片段,理論上同一個染色體上的read結合起來拼出一個contig,但實際上做不到.contig中所以的鹼基序列是已知的 在高通量測序前,會構建一定長度的文庫（譬如8k的。
測序中p1接頭有什麼用？用在哪？
2樓：土豆檸檬絲
要了解p1接頭有什麼用，首先要知道p1接頭是什麼？
p1接頭是二代測序中加入到接頭序列，主要包括和flow cell上互補的olgo序列和測序引物（一般barcord序列在p2接頭上）
用處：1，與flow cell上的序列互補結合從而使待測序列結合到flow cell上 2.具有測序引物序列，使得測序能與待測文庫片段結合，進而完成測序。
用在哪？p1接頭一般是在文庫構建中接到待測的片段上。另外在二代測序資料分析中，由於一些片段太短（比如你測序是測100bp，但是你的待測片段沒有100bp長度），使得測序結果中有接頭序列，我們在資料分析第一步中需要去除接頭序列。
不過很少見，一般情況下，測到的都是p2接頭，除非你的文庫構建的長度範圍比較廣，才有可能在read2的測序中測到p1接頭。
高通量測序中 p1接頭的作用及連線接頭反應原理 10
3樓：土豆檸檬絲
接頭在illumina中一般分為p5和p7接頭，其中一個帶有和flow cell上的探針反向互補的序列，以完成待測序列和探針結合的作用，另外一個接頭帶有barcord序列以區分不同的樣本。
連線接頭反應，其原理為序列打斷後加鹼基a，隨後接頭t單鹼基互補連線。
高通量測序中建庫接頭的作用反應及原理
4樓：**ile我的愛人
接頭主要是為了測序，接頭上含有測序引物互補結合的片段序列，通過和測序引物結合來對目的片段進行測序
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