1樓:匿名使用者
組學omics,研究的是整體. 按照分析目標不同主要分為基因組學,轉錄組學,蛋白質組學,代謝組學。
基因組學研究的主要是基因組dna,使用方法目前以二代測序為主,將基因組拆成小片段後再用生物資訊學演算法進行迭代組裝。當然這僅僅是第一步,隨後還有繁瑣的基因註釋等資料分析工作。
轉錄組學研究的是某個時間點的mrna總和,可以用晶片,也可以用測序。晶片是用已知的基因探針,測序則有可能發現新的mrna,
蛋白組學針對的是全體蛋白,組要以2d-gel和質譜為主,分為top-down和bottom-up分析方法。理念和基因組類似,將蛋白用特定的物料化學手段分解成小肽段,在通過質量反推蛋白序列,最後進行搜尋,標識已知未知的蛋白序列。
代謝組分析的代謝產物,是大分子和小分子的混合物,主要也是用液相和質譜。
總而言之,這些技術都想從全域性找變數,都是一種top-down的研究方法,原因很簡單:避免『只緣身在此山中』的尷尬。
但因為技術侷限,都各有缺點,尤其是轉錄組和蛋白組資料,基本上顛覆了以前一直認為的mrna水平能代表蛋白水平的觀念,因為這兩組資料的重合度太低。
所以目前很多研究都開始使用交叉驗證方法。
無論如何,都需要對資料進行分析,有經驗的分析往往能化腐朽為神奇。
巨集基因組學的研究物件,巨集基因組學的介紹
巨集基因組學研究的物件是特定環境中的總 dna,不是某特定的微生物或其細胞中的總dna,不需要對微生物進行分離培養和純化,這對我們認識和利用95 以上的未培養微生物提供了一條新的途徑。已有研究表明,利用巨集基因組學對人體口腔微生物區系進行研究,發現了50多種新的細菌,這些未培養細菌很可能與口腔疾病有...
基因工程與基因組學有什麼區別
基因工程是在分子水平上,用人工方法提取或合成不同生物的遺傳物質 dn 段 在體外切割,拼接形成重組dna,然後將重組dna與載體的遺傳物質重新組合,再將其引入到沒有該dna的受體細胞中,進行復制和表達,生產出符合人類需要的產品或創造出生物的新性狀,並使之穩定地遺傳給下一代。按目的基因的克隆和表達系統...
蛋白質組學,轉綠組學能解決什麼問題
蛋白質組學和轉錄組學都是後基因組時代 post genomics era 中重要的組成部分,其中轉錄組學和基因組結合更緊密,能夠針對性的解決一些組織特異性相關的基因差異的問題,所以近幾年隨著越來越多的基因組獲得測序,加上轉錄組測序成本的降低,獲得了長足的進步,越來越多的物種的基因資訊得到了豐富,很多...