論述蛋白質組學與基因組學的區別和聯絡

2021-03-19 18:20:41 字數 624 閱讀 3534

1樓:匿名使用者

組學omics,研究的是整體. 按照分析目標不同主要分為基因組學,轉錄組學,蛋白質組學,代謝組學。

基因組學研究的主要是基因組dna,使用方法目前以二代測序為主,將基因組拆成小片段後再用生物資訊學演算法進行迭代組裝。當然這僅僅是第一步,隨後還有繁瑣的基因註釋等資料分析工作。

轉錄組學研究的是某個時間點的mrna總和,可以用晶片,也可以用測序。晶片是用已知的基因探針,測序則有可能發現新的mrna,

蛋白組學針對的是全體蛋白,組要以2d-gel和質譜為主,分為top-down和bottom-up分析方法。理念和基因組類似,將蛋白用特定的物料化學手段分解成小肽段,在通過質量反推蛋白序列,最後進行搜尋,標識已知未知的蛋白序列。

代謝組分析的代謝產物,是大分子和小分子的混合物,主要也是用液相和質譜。

總而言之,這些技術都想從全域性找變數,都是一種top-down的研究方法,原因很簡單:避免『只緣身在此山中』的尷尬。

但因為技術侷限,都各有缺點,尤其是轉錄組和蛋白組資料,基本上顛覆了以前一直認為的mrna水平能代表蛋白水平的觀念,因為這兩組資料的重合度太低。

所以目前很多研究都開始使用交叉驗證方法。

無論如何,都需要對資料進行分析,有經驗的分析往往能化腐朽為神奇。

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