我要研究的基因有多種轉錄變體(transcript va

2021-05-23 09:42:12 字數 2063 閱讀 8127

1樓:匿名使用者

具體的中文怎麼表達我不清楚,不過mrna有transcript variant 表明最終翻譯表達的蛋白可能有不同的isoform,這些isoforms有同樣的名稱,他們的基因名稱一樣。比如一個m基因,它的mrna有2個transcript variant :transcript variant 1和transcript variant 2,表達的蛋白是m,有兩個isoforms,分別是 m isoform 1和m isoform 2(也許會有通用的不同字尾,如α,β等)。

它們也許在功能上作用相似,或不同,要查具體的資料才知道。要看你的具體需求確定需要哪個transcript variant ,或者直接找所有transcript variant 的相同序列(如果是設計引物的話)。不知道這個答案能不能幫到你。

2樓:匿名使用者

如果是針對總的基因表達產物,可以尋找變體的共有序列(***mon sequence)——針對共有rna序列的特異性探針和針對共有多肽序列的特異性抗體,分別用於檢測mrna表達水平和蛋白質水平。

如果是想檢測某個剪接變異體,可以針對其特有序列設計探針、製備抗體。

3樓:manbu高中生

看看這個基因在你的細胞中的表達情況。

設計qrt-pcr引物時,一個基因有多個變體,要選擇哪一個來設計引物才能使定量準確些?

4樓:阿魯巴星人

1 基因有多種變體,該怎麼設計?

你如果僅僅檢測這個基因的表達量,你可以將引物設計在這多種變體的保守區域內,就是所有變體都包含的區域。如果你明確要檢測哪一個變體,就設計在這個變體獨有的區域內。

2 引物blast後的產物有多種

你應該是在ncbi上進行的primer blast吧?你只要看到你的引物擴增出來的都是你要的目的基因就好了。在ncbi上有很多標記,一般認為nm的是ncbi上認可的reference的序列,nx是使用者上傳還未認證的序列,你忽略也是可以的。

predicted是指使用者**的序列,建議你還是用ncbi認證的序列。

一個基因有很多轉錄本,怎麼選

5樓:

兩種反bai轉錄的方法,一種du

是用oligot作為引物zhi,把所有的mrna都反轉錄dao了,這個應該是有用版的。另一權種方法,是用特異性的引物去反轉錄,這個的話,你要看這種基因的轉錄後剪下有沒有把最後一個外顯子切掉的情況,如果沒有的話,也是可以用reverse primer去反轉錄的。 mrna的選擇方面,只要你提取mrna的細胞是有這種基因表達,且存在可變剪下的機制,這樣提取的mrna就可以做下一步實驗的。

一個基因為什麼會有多個轉錄本

6樓:哎喲帶你看娛樂

這是由於通過內含子的不同剪接可構成不同的轉錄本。

一條基因通過內含子的不同剪內接可構成不同的容轉錄本。設計轉錄本實驗可以研究內含子剪下機制、表觀遺傳、rna編輯等,考察一條基因對應的不同轉錄本的調節機制等。

以雙鏈dna中的確定的一條鏈(模板鏈用於轉錄,編碼鏈不用於轉錄)為模板,以a,u,c,g四種核糖核苷酸為原料,在rna聚合酶催化下合成rna的過程。作為蛋白質生物合成的第一步,進行轉錄時,一個基因會被讀取並被複製為mrna。

7樓:匿名使用者

有可變剪接,複比如說一制個真核生物的某個基因有5個外顯子,四個內含子,那麼有可能外顯子1.2.3.

4.5全部和在一起是個功能基因,也有可能1.3.

5和在一起是個功能,也有可能部分外顯子和內含子和在一起是個功能基因。這些雖然不一定發生在同一個細胞內,但確實在同一個基因內。還有就是也有可能指的是假基因存在,導致相同基因的不編碼區長度不同而形成家族,這樣的轉錄rna也有所不同的。

望有所助益。

8樓:匿名使用者

那要看你所選擇的基因表達氨基酸的序列是什麼樣的。

9樓:匿名使用者

通過內含子的不同剪下,就能夠產生多個亞型。這樣的做,可以在同一個基因產生多個蛋白,提供了一個使功能多樣性的途徑。至於如何控制不同剪下體亞型的生成,無話

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