1樓:匿名使用者
轉錄組測序前,需要對物種轉錄組的大小進行評估,評估方法如下:
對於有參考基因組回的物種,答可以分析基因組資訊,統計編碼基因的個數,及其鹼基數,從而估計物種轉錄組的大小,另外可以查詢相關或相近物種轉錄組研究的文獻,作為參考。對於無參考基因組的物種則只能參考相近物種的轉錄組大小。
轉錄組測序所需的測序量隨研究目的的不同而有所差異。目前,為保證資料分析結果的可靠性和準確性,推薦轉錄組測序採用最低4gb clean data進行後續分析,如果想檢測到低丰度的轉錄本推薦採用8gb clean data。
轉錄組測序有參考基因組和無參考基因組的區別
2樓:砂粒
轉錄組測序是rna水平測序,相當於dna水平的基因
組測序,是一個框架。表達譜主要研究的是基因表達量的變化,上調或下降。先要有轉錄組或是基因組才可以做表達譜,否則沒有ref做參考。
轉錄組測序和表達譜其實都是通過高通量測序技術進行的,轉錄組測序主要是針對沒有參考基因組(即基因組未完成測序)的物種,側重於獲得你材料的全部轉錄組資訊;而表達譜則側重於檢測各個基因的表達量。
有參考基因組的轉錄組測序怎麼樣
3樓:個人人
轉錄本是一bai個基因序列通過一種剪下後du所zhi
得的能rna.以前說轉錄dao本都是說表達蛋白的.現在
回lncrna的研究多了答,也說是一個轉錄本了.還有沒有參考基因組序列的,一般是不可能去go功能註釋的.因為去功能註釋的時候要有一個背景.
全基因組測序的內容,全基因組測序的意義是什麼？
1998年，克萊格 凡特的塞雷拉基因組公司成立，而且宣佈將在2001年完成定序工作。隨後國際團隊也將完成工作的期限提前。2000年6月26日，塞雷拉公司的代表凡特，以及國際合作團隊的代表弗朗西斯 柯林斯 francis collins 在美國 柯林頓的陪同下發表演說，宣佈人類基因組的概要已經完成。2...
全基因組測序可以檢測出平衡易位嗎
平衡易位用核型分析就可以檢測了，目前的基因晶片技術還不能檢測平衡易位。人家問得是全基因組測序你們說晶片幹啥？全基因組測序通過特別的策略可以分辨平衡易位，但是成功率低，不穩定，還在科研沒有用於臨床。全基因測序檢測檢測不出平衡移位，全基因測序只能得到一大批無用的資料。這些資料有什麼用，需要基因解碼，這個...
現在已經有了物種全基因組測序，該怎麼對該物種每個基因進行分析
這個來問題要是能夠完美回答就沒有那源麼多國內外生物學家仍在努力奮鬥了。事實上，全基因測序得到就如一本 天書 我們還是像以前那樣，比如研究某個基因，任然要做很多實驗，各個層次的，分子的蛋白的，研究基因產物的功能結構，和別的蛋白質的關係，受什麼影響，細胞定位如何 遺傳學和分子生物學 但是有了基因組測序的...