ncbiembl和什麼並稱三大資料庫

2021-03-19 18:19:01 字數 862 閱讀 6667

1樓:匿名使用者

ddbj:dna data base of japan 是日本人建立的核酸資料庫;

ncbi中的genbank是美國建立的核酸資料庫;

embl是歐洲建裡的核酸資料庫;

這三個資料庫是連通的,資料共享。

2樓:手機使用者

,是一個基因庫,可以查詢已知序列,還可以查詢文章,登記序列等等,不管是篩選細菌還是做分子實驗,都是很有用的**

ncbi選擇資料庫

3樓:匿名使用者

原理很簡單後者是前者的子集。chromosome只包含所有已經測序的基因組資料。估計你的序列可能只是在高等生物中保守,所以才會出現選擇chromosome資料庫時相似數量下降非常多。

在做blast的時候,我們通常需要根據不同的目的選擇不同的資料庫。例如,要看一下測的序列是不是子集所期望的序列,以及,那nr資料庫是最好的選擇。至於以誰為準,因需要解決的問題而異。

讀一下blast每個資料庫的定義,對於你選擇資料庫最有幫助。有一個基本原則是:nr資料庫可以滿足絕大多數的需求。

少數特殊需求可以通過其他資料庫完成,例如最近30天內的更新序列,搜尋新基因這是必查的;題目中的chromosome資料庫是隻包含了全基因組或全染色體的資料。詳參ncbi blast說明。

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