1樓:匿名使用者
你做的是什麼蛋白,一般來說不用,核酸很好去掉。
蛋白質組學樣品前處理的方法
2樓:匿名使用者
要回答這個問題,首先需要理解樣品前處理需要達到的目的:減少人為降解和修飾,並且儘量多的釋放肽段。
整個過程可以分為以下流程:先從組織、體液或細胞中提取蛋白質,拿到蛋白混合溶液(根據你的研究目的,可以對蛋白先做分離,或者不分離),接下來還原烷基化(還原的過程是將蛋白的二硫鍵開啟,然後烷基化可以修飾巰基,防止遊離的巰基再生成二硫鍵)處理,並酶解成肽段。
1,樣品的收集與儲存
組織樣品
1) 對於人體手術切除的組織,有條件的話,最好用pbs(磷酸緩衝鹽溶液,作為溶劑,起溶解保護試劑的作用)取完之後直接去血。如果沒有去血,可以-80℃液氮儲存,乾冰運輸。
2)對於小鼠、大鼠、兔子之類的組織樣品,建議用灌流的方式來去血,尤其是像肝臟、胃、心臟這類大的組織,可以直接用灌流的方式去血,去得最乾淨。其次的方案是在後期剪碎的時候去血。
細胞樣品
常規實驗,建議收到5*1e6~1e7個細胞以上的樣品量(有些實驗需要的樣品量會少一些,後面會詳細講)。細胞取好後,首先用pbs清洗一下細胞表面,因為大部分培養基裡面都含有血清,這部分血清得洗乾淨了先~
如果是做分泌蛋白研究的話,首先用pbs清洗樣品幾次,再用條件培養基(不含有血清的培養基)進行培養,根據細胞情況,大概12個小時以後,離心,去掉細胞碎片,取上清,就能提取到分泌蛋白了。
血清樣品
1)血漿樣品:可以通過醫院常用的edta抗凝管進行收集,收集到的血漿會呈懸浮狀態,離心去掉血細胞。
2)血清樣品:現在大部分研究都直接針對血清樣品,它的成份更簡單,沒有凝集素,沒有大量的血細胞,針對性會更強。收集血清樣品時,直接把血清吸到管子裡,室溫靜置讓它凝結,上清黃色部分就是血清樣品啦。
2,研磨或超聲破碎樣品,為了減少人為操作引入的修飾,通常會準備大量的冰,進行冰上的操作。同時還需要加入蛋白酶抑制劑,防止在操作過程中蛋白被樣品中自帶的蛋白酶降解掉。
3,充分熔接蛋白質,如果蛋白沒有充分溶解,能提取到的蛋白就會很少,達不到研究目的。
4,充分解旋蛋白質,通常,蛋白質都是成球狀的穩定狀態,解旋蛋白質就是將球狀蛋白中的二硫鍵開啟,讓它形成鏈狀結構,以便進行下一步酶切。
5,酶解蛋白質,一般會用多種酶對蛋白質進行酶解。
6,去除雜質,我們要知道,質譜是一個非常靈敏的儀器,它檢測的是多肽的質荷比。所有的鹽類,以及所有會進行離子化的雜質,都會干擾到肽段的檢測。所以我們會要求進入質譜之前的蛋白樣品非常乾淨。
在蛋白水平及肽段水平都會進行去除雜質的步驟。
更詳細的,下次再聊~
3樓:匿名使用者
溶劑提取法
同一溶劑中,不同物質具有不同的溶解度。利用混合物中各物質溶解度的不同將混合物組分完全或部分分離的過程稱為萃取,也稱提取。常用方法有以下幾種。
(一)浸提法
浸提法又稱浸泡法。用於從固體混合物或有機體中提取某種物質,所採用的提取劑,應既能大量溶解被提取的物質,又要不破壞被提取物質的性質。為了提高物質在溶劑中的溶解度,往往在浸提時加熱。
如用索氏抽提法提取脂肪。提取劑是此類方法中重要因素,可以用單一溶劑,也可以用混合溶劑。
(二)溶劑萃取法
溶劑萃取法用於從溶液中提取某一組分,利用該組分在兩種互不相溶的試劑中分配係數的不同,使其從一種溶液中轉移至另一種溶劑中,從而與其他組分分離,達到分離和富集的目的。通常可用分液漏斗多次提取達到目的。若被轉移的成分是有色化合物,可用有機相直接進行比色測定,即萃取比色法。
萃取比色法具有較高的靈敏度和選擇性。如雙硫腙法測定食品中的鉛含量。此法裝置簡單、操作迅速、分離效果好,但是成批試樣分析時工作量大。
同時,萃取溶劑常易揮發,易燒.且有毒性,操作時應加以注意。
鹽析法向溶液中加入某種無機鹽,使溶質在原溶劑中的溶解度大大降低,而從溶液中沉澱析出,這種方法叫做鹽析。如在蛋白質溶液中加入大量的鹽類(硫酸銨),特別是加入重金屬鹽,使蛋白質從溶液中沉澱出來。
在進行鹽析工作時,應注意溶液中所加入的物質的選擇。它應是不會破壞溶液中所要析出的物質,否則達不到鹽析提取的目的。
化學分離法
(一)磺化法和皂化法
這是處理油脂或脂肪樣品時經常使用的方法。例如,殘留農藥分析和脂溶性維生素測定中,油脂被濃硫酸磺化,或被鹼皂化,由疏水性變成親水性,使油脂中需檢測的非極性物質能較容易地被非極性或弱極性溶劑提取出來。
(二)沉澱分離法
沉澱分離法是利用沉澱反應進行分離的方法。在試樣中加入適當的沉澱劑,使被測組分沉澱下來,或將干擾組分沉澱除去,從而達到分離的目的。
(三)掩蔽法
利用掩蔽劑與樣液中的干擾成分作用,使干擾成分轉變為不干擾測定的狀態,即被掩蔽起來。運用這種方法,可以不經過分離干擾成分的操作而消除其干擾作用,簡化分析步驟,因而在食品分析中應用十分廣泛,常用於金屬元素的測定。
蛋白純化怎麼去除核酸
4樓:因為不懂才註冊
1、根據所選蛋白的性質,選擇合適的介質和條件,想辦法把蛋白結合在柱子上,(有tag的話用這個方法最好了),然後用高鹽(0.5-3m nacl)洗,一般會洗下來一個峰,就是被洗下來的核酸了。
2、試試在高鹽條件下加mn2+,因為高鹽可以讓核酸和蛋白分離,而mn2+對核酸沉澱有一定的效果。
但是要十分小心的是,這類蛋白本身的天然性質就是要結合核酸的,有的時候核酸去除乾淨了,蛋白也沉澱了,所以沒那麼容易,很多小條件要結合所選的蛋白自己去摸索。
5樓:匿名使用者
可以在大腸桿菌裂解的時候就加入核酸酶,通過核酸酶消化胞內的核酸,當核酸變成小片段的時候就很容易被去除掉。
利用陰離子交換層析 q 來去除核酸,q柱對於核酸有很強的吸附作用,需要很高的鹽濃度才能洗脫下核酸,可以很容易的去除蛋白溶液中的核酸。
利用分子篩去除核酸,核酸是大分子物質,一般會在分子篩的外水體積中被去除掉。
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