1樓：匿名使用者
編碼同一氨基酸的不同密碼子稱為同義密碼，其差別僅在密碼子的第3位鹼基不同。
不同種屬間使用同義密碼的頻率有很大差異，如人類基因中，丙氨酸（ale）密碼子多為gca,gcc或gct,而gcg很少使用。
密碼子偏好性研究 5
2樓：匿名使用者
不同的生物，甚至同種生物不同的蛋白質編碼基因，對簡併密碼子使用頻率並不相同，具有一定的偏愛性，其決定因素是：生物基因組中的鹼基含量 在富含at的生物（如單鏈dna噬菌體fx174）基因組中，密碼子第三位上的u和a出現的頻率較高；而在gc 豐富的生物（如鏈黴菌）基因組中，第三位上含有g或c的簡併密碼子佔90%以上的絕對優勢。已知dnag和rpod（編碼rna聚合酶亞基）及rpsu（30s核糖體上的s21б蛋白）屬於大腸桿菌基因組上的同一個操縱子，而這3個基因產物在數量上卻大不相同，每個細胞內僅有dnag產物50拷貝，而rpod為2800拷貝，rpsu則高達40 000拷貝之多。
研究dnag序列發現其中含有不少稀有密碼子，也就是說這些密碼子在其他基因中利用頻率很低，而在dnag中卻很高。許多調控蛋白如laci、arac、trpr等在細胞內含量也很低，編碼這些蛋白的基因中密碼子的使用頻率和dnag相似，而明顯不同於非調節蛋白。高頻率使用這些密碼子的基因翻譯過程極容易受阻，影響了蛋白質合成的總量。
細胞內對應於稀有密碼子的trna較少，高頻率使用這些密碼子的基因翻譯過程容易受阻，影響了蛋白質合成的總量。
如何在ncbi中查基因密碼子偏好性
3樓：匿名使用者
ncbi沒有這樣的資料，你可以在codonusagedatabase查到相關物種的密碼子偏好資訊。
codonusagedatabase資料庫用以計算密碼子偏好的序列資料都是來自ncbi，也是學術界和工業界經常使用的資料庫。該資料庫是用物種名索引的。使用之前必須首先搞清楚你所研究物種的拉丁名（例如 homo sapiens）。
也可按字母瀏覽。不過在檢索方式上，該資料庫不象其他的生物資訊學資料庫那麼靈活，其對檢索詞要求比較嚴格。可能的原因是有些物種的拉丁名非常相似（例如只差一個數字），如果出差錯的話，就是「差之毫釐 謬以千里」。
因此，反覆核對物種名應該是使用該資料庫最重要的步驟。
如果要計算單個或一組基因可以用其提供的countcodon的服務
什麼是生物體密碼子偏愛性？
4樓：學無止境
遺傳資訊在由mrna到蛋白質的傳遞過程中是以三聯體密碼子的形式傳遞的。每種氨基酸至少對應一個密碼子，最多的有6種對應的密碼子。編碼同一種氨基酸的密碼子稱為同義密碼子。
在蛋白質的合成過程中，同義密碼子的使用概率並不相同。某一物種或某一基因通常傾向於使用一種或幾種特定的同義密碼子，這些密碼子被稱為最優密碼子(optimal codon)，此現象被稱為密碼子偏愛性(codon usage bias)。
5樓：歸山狼
有些氨基酸會有多個密碼子，在進行蛋白質合成過程中，並不是所有的負載trna都能和mrna互補結合運載氨基酸，而是這些trna中的幾個會參與蛋白質的合成過程。這就是所謂的偏愛性。
希望你滿意。
遺傳資訊，密碼子和反密碼子的區別
主要有以下區別。1 位置 不同。密碼子存在於mrna上，是mrna上由三個相鄰鹼基組成的一組三聯體，每一組都只代表一種氨基酸。而反密碼子存在於trna上，可與mrna中的三聯體密碼子形成鹼基配對的三個相鄰鹼基。2 作用不同。密碼子的作用是在蛋白質合成時確定在蛋白質肽鏈中的哪個位置是哪種氨基酸。而反密...
反密碼子中哪個鹼基對參與了密碼子的簡併性
同一種氨基酸具有兩個或更多個密碼子的現象稱為密碼子的簡併性 degeneracy 密碼子簡併性具有重要的生物學意義,它可以減少有害突變.簡併性使得那些即使密碼子中鹼基被改變,仍然能編碼原來氨基酸的可能性大為提高.密碼的簡併也使dna分子上鹼基組成有較大餘地的變動,例如細菌dna中g c含量變動很大,...
遺傳密碼有哪些基本特徵遺傳密碼子有哪些特點請列舉出來並進行簡要解釋
1 方向性，密碼子是對mrna分子的鹼基序列而言的，它的閱讀方向是與mrna的合成方向或mrna編碼方向一致的，即從5 端至3 端。2 連續性，mrna的讀碼方向從5 端至3 端方向，兩個密碼子之間無任何核苷酸隔開。mrna鏈上鹼基的插入 缺失和重疊，均造成框移突變。3 簡併性，指一個氨基酸具有兩個...