NCBIgi表示什麼,NCBI中Gl什麼意思

1樓：匿名使用者

gi是序列（如gene，protein，mrna...）存入ncbi資料庫時順序assign的一個數字，便於database管理和監控。

值得注意版的是gi和基因編號權（geneid)無關，後者是針對每個基因的特異編號

ncbi 中gl 什麼意思

2樓：匿名使用者

np_001044802.1是登入號；115441045是叫gi號。從你自己例子裡體現了兩者的一個基本差別：

gi號完全是數字，登入號是字母與數字的組合，通常字母代表一定的含義。關於gi與登入號的區別可以參考下面給出的連結。

這裡主要討論一下登入號的樣式：

1）使用者遞交序列號，這些登入號通常不含下劃線。

首先我們討論一下locus name，它不是登入號，但在ncbi的發展中佔據一定的地位。在ncbi的genbank記錄中，locus關鍵字下包括許多資訊，其中之一就是locus name。位點名稱設計之初是用來幫助研究人員歸併相似序列。

名稱命名規則是[a-z][0-9]。首字母通常為物種名的首字母。locus概念最適合基因突變資料的收集，所以突變資料的最初都是按照locus概念設計的。

隨著genbank資料的擴大，6個資料明顯不能適應資料的增長，於是增加到8位，也就是登入號，其編碼規則[a-z][a-z][0-9]。前兩個字母是物種拉丁名首字母(不是很確定)，後面是6個序號。因此登入號也就代替了locus名稱。

2）refseq序列

由於genbank開埠之初，並不控制序列質量，所以會有許多的冗餘。因此ncbi就通過利用計算機演算法把一致的序列歸併在一起，這些人工生成的序列都是用類似np_***xx的格式編碼，嚴格的編碼規則是[anxyz][cpgmprtwzs]_([a-z])?[0-9]。

下面的登入號樣例就是用這個正規表示式提取的，供參考。

最後補充一點的是序列後的「點數字」代表不同的版本，詳參參考連結。